Le nouveau directeur des données de Fred Hutch, Jeffrey Leek. (Photo gracieuseté de poireau)

Le Fred Hutchinson Cancer Research Center de Seattle a recruté un nouveau vice-président et directeur des données : le biostatisticien et éducateur en science des données Jeffrey Leek. Leek commencera dans la position nouvellement formée d’ici le 1er juillet, a annoncé mardi Hutch.

Leek quittera son poste actuel de professeur de biostatistique et d’oncologie à la Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health et codirecteur de son Data Science Lab.

Il développe des outils pour aider à comprendre les données génomiques et biomédicales à grande échelle et a contribué à générer des programmes d’apprentissage en ligne qui ont inscrit plus de 8 millions de personnes. Il dirige également Data Trail, qui forme et soutient les communautés mal desservies pour le travail dans la science des données, et en 2020 a cofondé la startup de gestion des données Streamline Data Science.

Leek arrivera au Hutch alors que l’institution élabore une nouvelle structure de partenariat proposée avec UW Medicine, Seattle Children’s et la Seattle Cancer Care Alliance, et il façonnera une entreprise de données intégrée.

Son déménagement est en quelque sorte un retour aux sources – le natif de l’Idaho a obtenu son doctorat. à l’Université de Washington et a entretenu des relations avec des chercheurs régionaux. Il rejoindra également la faculté Fred Hutch en tant que professeur à la division des sciences de la santé publique.

Nous avons discuté avec Leek de ses projets chez Fred Hutch, de la façon dont il envisage l’intégration de l’institution dans la communauté technologique et entrepreneuriale et de ses projets d’étendre l’enseignement de la science des données. L’interview suivante a été éditée par souci de concision et de clarté.

GeekWire :                                                                                                                                                                                         . De quoi êtes-vous le plus excité ?

Jeffrey poireau : Je suis enthousiasmé par la possibilité de créer un écosystème de données à l’échelle institutionnelle. Je dirige le Johns Hopkins Data Science Lab ici depuis quelques années, et nous faisons beaucoup de formation au développement d’infrastructure et à la gestion des données, des cours ouverts en ligne massifs sur Coursera. Cette opportunité est de prendre cette réflexion et de la mettre à l’échelle d’une institution et de trouver un moyen d’aider tout le monde au Hutch à utiliser les données de manière plus efficace, plus facile et plus amusante. Les chercheurs y sont de classe mondiale totale, et c’est amusant d’imaginer les nouvelles collaborations que nous allons construire. Faire partie du grand écosystème de données et de technologie de Seattle est également incroyablement convaincant.

GeekWire : Qu’est-ce qui constitue un écosystème de données ?

Poireau: Il s’agit de mettre en place les bonnes technologies, de faciliter l’utilisation des données, d’intégrer les bonnes préoccupations en matière d’éthique et de confidentialité, puis de former les gens à utiliser les données d’une manière qu’ils n’avaient peut-être pas pu faire auparavant. Et donc, tout cela ensemble crée un environnement dans lequel vous pouvez accélérer tout un tas de types de recherche différents, de la recherche sur le cancer aux maladies infectieuses en passant par tout le reste.

GeekWire : Quelles sont les opportunités de rassembler des données dans les instituts de recherche de la région de Seattle ?

Poireau: Les données collectées sur tous les différents traitements et protocoles dans ces institutions peuvent être rassemblées de manière à nous permettre de faire des analyses à grande échelle, d’identifier quelles thérapies fonctionnent au sein de quelles sous-populations et d’identifier des hypothèses pour le suivi des futures rechercher. Le véritable enthousiasme qui l’entoure est de pouvoir exploiter les données de ces institutions pour répondre à certaines des questions auxquelles il est vraiment difficile de répondre à l’échelle d’une seule institution. Lorsque vous avez un événement ou un effet secondaire rare, il est plus difficile de le voir.

(Photo de Fred Hutch)

GeekWire : Comment voyez-vous Fred Hutch s’intégrer dans la communauté plus large de la technologie et de l’entrepreneuriat ?

Poireau: The Hutch réfléchit vraiment aux points d’une relation mutuellement bénéfique entre l’institution et les partenaires privés – qu’il s’agisse d’investisseurs pour aider à soutenir la filature d’idées axées sur la science des données, ou de parler à des partenaires potentiels d’étendre la taille et la portée des analyses. que nous pouvons faire. Vous voulez faire très attention à maintenir la confiance de l’entreprise à but non lucratif, tout en trouvant des moyens de tirer le meilleur parti de l’infrastructure privée pour collaborer à la création de meilleures solutions pour les patients. C’est une chose difficile à naviguer.

GeekWire : Comment voyez-vous Hutch travailler avec des acteurs plus importants comme Amazon et Microsoft, par rapport à des startups plus petites ?

Poireau: Il y a certainement des différences et des opportunités. Avec les grandes entreprises, mon expérience a été, et ce que j’ai hâte de faire, c’est de commencer par de petits points de contact. Ainsi, vous trouvez un chercheur qui a un besoin vraiment sérieux, comme mettre à l’échelle un tableau de bord contenant des données sur les maladies infectieuses à une grande communauté, ou peut-être avez-vous un partenaire technologique à grande échelle qui possède déjà des technologies existantes. Et puis une fois que vous avez construit cette première relation, vous pouvez en quelque sorte évoluer à partir de là pour identifier d’autres endroits où vous pouvez grandir. J’ai découvert que ce qui aime vraiment allumer un feu, c’est d’identifier les personnes qui sont excitées par un problème commun et de les amener à travailler ensemble et à trouver une solution. Et puis verser le soutien institutionnel derrière cela peut vraiment faire exploser des idées cool dans le public.

GeekWire : Pouvez-vous développer le rôle de Hutch dans le partenariat ou la promotion de startups ?

Poireau: Il y a tout, des technologies de licence à l’identification de moyens de soutenir les stagiaires qui se voient devenir une communauté plus semblable à une startup plutôt que de se lancer dans des universitaires. Comment pouvons-nous créer cette infrastructure de soutien, afin que les gens avec ce genre de passion puissent le faire? Il s’agit d’établir des relations entre des personnes qui souhaitent résoudre des problèmes similaires. Je pense qu’il y a beaucoup de place pour la créativité, en particulier dans l’espace des données, de l’apprentissage automatique et de l’IA à l’interface entre la biotechnologie et la science des données.

GeekWire : Dites-nous en plus sur vos efforts de sensibilisation avec Data Trail et comment vous pensez que cela s’intégrera dans votre travail à Seattle.

Poireau: Les personnes qui suivent des cours ouverts en ligne massifs sont déjà bien éduquées, comme les personnes de niveau master qui essaient de changer de carrière. Et nous avons donc commencé à concevoir comment pourrions-nous créer un programme qui amènerait des personnes de la communauté dans l’entreprise de données à Hopkins. Nous avons élaboré un programme de formation conçu pour la science des données de base et la gestion des données et nous nous sommes associés à des organisations à but non lucratif communautaires pour identifier des étudiants en mathématiques et en sciences talentueux dans notre quartier. Nous leur avons fait suivre un programme de tutorat où nous les payions pour suivre les cours, leur fournissions des ordinateurs portables et travaillions avec des partenaires à but non lucratif pour leur apporter un soutien social et financier. Nous avons travaillé avec Johns Hopkins afin qu’ils puissent devenir des gestionnaires de données et de science des données d’entrée de gamme, et avons créé cette voie dans l’écosystème Johns Hopkins. Je suis vraiment ravi que Data Trail à Seattle commence à se développer. Nous espérons également l’exécuter dans d’autres endroits du pays.

GeekWire : Dernières pensées?

Poireau: L’une des choses que j’aimerais vraiment faire en termes d’écosystème technologique est de commencer à établir des liens avec des personnes passionnées par la recherche sur le cancer et la formation en science des données open source, l’une des choses dont j’ai parlé dans l’écosystème. J’espère participer activement à ce système et aux gens qui s’y trouvent. J’espère que les gens de ce côté me contacteront s’ils sont enthousiastes à l’idée de travailler avec nous, et je prévois de tendre la main dans l’autre sens également.

Laisser un commentaire

Votre adresse e-mail ne sera pas publiée.